216 410 espèces inventoriées en France

C’est le nombre d’espèces recensées sur le territoire français. Parmi elles, 10,7 % sont endémiques (présentes uniquement sur un territoire, principalement en Outre-mer), ce qui confère une certaine responsabilité dans leur préservation.

« Si ces espèces disparaissent chez nous, elles disparaissent pour l’humanité », souligne Romain Julliard, professeur au Centre d’écologie et des sciences de la conservation (CESCO) du Muséum national d’Histoire naturelle.

Le chercheur insiste toutefois sur un point peu mentionné dans l’étude : à côté des extinctions, l’autre enjeu majeur est celui de l’érosion globale du vivant.

« Il n’y a pas que la nature dite “remarquable” : des espèces très abondantes comme le ver de terre restent communes, mais leurs effectifs diminuent d’année en année. Cela pose de réels problèmes pour les services qu’elles rendent aux activités humaines. »

18 % des espèces sont menacées ou éteintes

Malgré cette responsabilité, 18 % des espèces évaluées par l’Union internationale pour la conservation de la nature (UICN) sont aujourd’hui menacées ou éteintes. « Les amphibiens sont les plus vulnérables, car leur cycle dépend fortement des zones humides, elles-mêmes très exposées au changement climatique et aux changements d’usages des sols comme le drainage. De plus, beaucoup d’espèces sont très localisées », alerte l’écologue.

En quinze ans, les populations de chauves-souris ont chuté de 43 % en France. Les oiseaux spécialistes (dépendants d’un habitat précis, comme l’alouette des champs ou le pic épeiche) ont, eux, décliné de 37 points depuis 1989. À l’inverse, les oiseaux généralistes (pigeon, merle) ont progressé de six points, signe d’une banalisation des milieux et d’une perte de diversité.

16 % des habitats en état favorable de conservation

Seuls 16 % des habitats d’intérêt communautaire sont aujourd’hui en état favorable. « Ce sont des milieux peu transformés, où l’on trouve des espèces notables », précise Romain Julliard. Autrement dit, 84 % de ces habitats sont dégradés, contre 80 % il y a six ans. Les principales causes sont les pratiques intensives ou la déprise agricole, ainsi que l’artificialisation des sols.

Et ce chiffre a de lourdes conséquences. « La consommation d’habitat est la première pression sur la biodiversité », pointe le chercheur. S’y ajoutent l’exploitation des ressources, la pollution, le changement climatique et, enfin, les espèces invasives, particulièrement dans les territoires ultramarins insulaires. Quant à la pollution lumineuse, elle reste selon lui « difficile à isoler des effets de l’artificialisation : la lumière est là où l’on construit ».

D’une région à l’autre, les situations varient fortement : en Méditerranée, par exemple, tous les habitats marins d’intérêt communautaire sont en état défavorable.

6 720 espaces protégés en France

Petite note positive du rapport : la France compte 6 720 espaces protégés (Zone Natura 2000, parcs naturels…) et a mis en place de 76 plans nationaux d’action (PNA), couvrant plus de 470 espèces, avec des résultats parfois significatifs.

Les populations d’oiseaux d’eau hivernants (cormorans, cigognes…) ont ainsi augmenté de 135 % entre 1980 et 2025.

« Là où les mesures sont mises en place, elles sont souvent efficaces : lorsque la pression diminue, la biodiversité se reconstitue rapidement », observe Romain Julliard.

Mais cette stratégie a ses limites : « Pour atteindre un tel niveau de protection, il faut réduire fortement les activités humaines, ce qui n’est pas généralisable à grande échelle. » Aujourd’hui, seuls 0,95 % du territoire métropolitain bénéficient d’une protection forte (cœurs de parcs nationaux, réserves naturelles…), notamment en raison de ces difficultés.

Un angle mort demeure : la protection de la biodiversité dite ordinaire, présente dans les espaces agricoles, forestiers ou urbanisés.

« C’est beaucoup plus complexe à mettre en œuvre : il faut concilier biodiversité et agriculture, biodiversité et exploitation forestière, biodiversité et urbanisation. En bref, c’est toute la politique de transition écologique qu’il faut mettre en œuvre », conclut le chercheur.

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